Se você conseguir realizar a Auditoria de Certificação até o final do 1º. Semestre de 2017, eu recomendo manter a documentação atual e Certificar no Regimento SIAC 2012, e durante a Auditoria de Supervisão no próximo ano realizar a migração para o novo SIAC 2016.
Porém se for certificar no segundo semestre, recomendo que faça as atualizações necessárias para a Certificação no Regimento do SiAC 2016.